macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-02-22から1日間の記事一覧

ゲノム中のISエレメントを探す ISEScan

ISEScanは、ゲノム中のIS(Insertion Sequence)エレメントを同定するためのPythonパイプラインである。完全なISエレメントを報告するか、完全なISエレメントと部分的なISエレメントの両方を報告するかのオプションがある。メテゲノムアセンブリに含まれるISエ…

事前計算された植物の遺伝子ファミリーの系統樹 PhyloGenes

著者らは、シロイヌナズナや他のモデル生物から得られた遺伝子機能に関する知識を、他の植物種に正確かつ効率的に伝達できるようにすることを目指している。このような知識移転は、植物の系統における個々の遺伝子やゲノム全体の重複のために、植物において…