HMM
eggNOG 5.0のペーパーより 分化イベント後に共通の祖先から分岐したオルソログを同定することは、分子生物学および進化生物学における基本的な課題である。 duplication eventの後に分岐した配列であるパラログと比較して、オルソログは長い進化的タイムスケ…
次世代シーケンシング技術の進歩は、環境試料（すなわちメタゲノム）内の遺伝物質の全コレクションを直接シーケンシングしようと試みるメタゲノム研究を促進した。メタゲノムアセンブリは利用できないことが多いので（論文執筆時点）、ショートリードから直…
2019 6/25インストール追記 HMMERはタンパク質のドメイン検索に使われるツール。Pfamなどのタンパク質ドメインのデータベースを使い、ドメインの検索を行ってアノテーションをつけることができる。ここではhmmscanを試す。 webサーバー https://www.ebi.ac.u…
2018 10/6 タイトル修正 2019 4/3 説明修正 2019 4/12 dockerリンク追加 2019 5/27 インストール方法追加 2019 7/6 dockerリンク修正 2019 7/6 コマンド修正、help追加、タイトル修正 2019 8/24 インストールの説明の誤り修正、バージョンアップ追記 2019 8/…
