2018-05-23から1日間の記事一覧
2019 5/20 condaインストールおよび引用追記、コメント削除 PEARはオーバーラップするペアエンドリードをマージするツール。フラグメントサイーズがリード長x2より小さい場合、ペアエンドリード間にオーバーラップが存在する。PEARはこのオーバーラップ領域…
生物種の推定 (taxonomic profiling)
metagenome
結果の視覚化 (visualization)
高速なツール
protein search
2016
Nature Communications
taxonomic assignment
fungi
microbial eukaryotes
virus
archaea
bacteria
Marine Metagenomics
abundance estimation in metagenomics data
2018 10/7 タイトル修正 、11/20 conda追加、12/12 テスト追記 2019 4/26 データベース追記 2022/06/25 help更新, 2033/09/26 コマンドの一部更新 ランダムDNAショットガンシーケンシングを使用すると、実験室培養を必要とせずに環境サンプルから全ゲノムDNA…
2019 1/17 condaインストール追記 2019 1/29 追記 2020 7/23 誤字修正 2020 7/24 help更新、例修正 シーケンシング技術の急速な進歩により、微生物の大量シーケンシングデータを作成することが可能になった。このようなデータの解析では、コンティグやリード…
