secondary metabolites
植物、微生物、菌類は、多くの場合、1つまたはいくつかの種にユニークな多種多様な特殊な代謝物を生成する。文明の夜明けから、人間は薬用、経済的、またはレクリエーション目的でこの宝の山を利用している。過去10年以内に、ゲノムに基づいた特殊な代謝産物…
2019
Frontiers in Genetics
metagenome
automated pipeline
annotation
結果の視覚化 (visualization)
taxonomic assignment
生物種の推定 (taxonomic profiling)
abundance estimation in metagenomics data
pathway
rRNA
database
GO term
enzyme
Binning (metagenomics)
secondary metabolites
metabolism
2019/10/24 MetaCycの結果追記 ゲノムアノテーションは、文字通り、アセンブリされたDNA分子の特徴の注釈である。そのような特徴は、そもそも、タンパク質をコードする遺伝子[「オープンリーディングフレーム」（ORF）]およびリボソームまたはトランスファー…
gene cluster
secondary metabolites
bacteria
ゲノム比較 (comparative genomics)
plant
fungi
duplication
database
web tool
2017
Nucleic Acids Research
2019 6/17 インストール追記 2020 5/15 help追加 2020 7/9 ローカルでの実行例記載 二次代謝産物または特殊代謝産物とも呼ばれる天然の産物（Natural products）は、多くの薬の基礎であり、農業および栄養学の応用にとって重要な分子でもある。さらに、分子…
