macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

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review article要約 バクテリアのバリアントコール評価のベストプラクティス

Best practices for evaluating single nucleotide variant calling methods for microbial genomicsより https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4493402/ シークエンシング技術の革新により、生物学の研究者はbiologicalなシステムの理解を大幅に進…

NGSデータ解析マシンのスペックによるデータ解析時間の違い

あけましておめでとうございます。今年もよろしくお願いします。 NGSのデータ解析で時折聞かれるのが、解析マシンのスペックはどれくらいあれば十分かというような質問である。一般的にはメモリリッチで、I/Oが高速で、CPUのマルチスレッドに対応したマシン…