macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Scientific Reports - Nature

ミドルサイズのindelを検出する IMSindel

挿入および欠失(indel)は、フレームシフトの導入による遺伝子機能の根本的な変更を介してたくさんのヒト疾患に関与している。しかし、次世代シークエンシングデータからのこれらのindelを正確に検出する事は現在でもチャレンジングである。これは、DNAシー…

メタゲノムの自動解析パイプライン MyCC

MyCCは全プロセスを自動化したメタゲノム解析ツール。contigのfastaファイルを入力すると、配列の特性に従って自動で分類し、binning向けに色がついた図を描画し、さらにクラスタリングされたfastaまで出力することができる。既存のカバレッジやペアリードの…