10/5 3stepコマンドの誤り修正 及びコマンド変更、コメント追加 正確で完全でアノテーションのついたゲノムは、種や個体の過去、現在、未来に関する豊富な情報を提供するため、医療や生物学の研究にとって非常に貴重なリソースとなっている[論文より ref.1]…

in silico mate-pairシーケンシングによってde novo アセンブリ改善を試みる cross-species-scaffolding

イルミナはmate pairシーケンスのキットも販売している。このプロトコルではNextraのトランスポゾンでタギングしたゲノムをセルフライゲーションさせて離れた配列を近づける。そのため中央にジャンクション配列が残る（図１ 赤の配列）。NxTrimはそのジャン…

Nextera Mate Pair protocolのジャンクションプライマー除去ツール NxTrim