Hi-C
2020
GigaScience
Hi-C
10X Genomics
assembly
polish
large genome
Reference-assisted assembly
automated pipeline
脊椎動物ラージゲノムの全ゲノムショットガン（WGS）アセンブリは、過去20年間のバイオインフォマティクス研究の重要なテーマだが、脊椎動物の大型ゲノムについては、単一のバイオインフォマティクスツールを用いて完全にアセンブリされた染色体を得ることは…
pyGenomeTracksは、高度にカスタマイズ可能な高品質のゲノムブラウザトラックを作成することを目的としている。Hi-Cデータの他、以下のデータからplotを作成することが可能になっている。 bigwig bed/gtf (many options) bedgraph epilogos narrow peaks lin…
Hi-C
Preprint
2019
assembly
Reference-assisted assembly
plant
ゲノム比較 (comparative genomics)
large genome
Genome Biology
2019 2/12スライド追加 2019 10/29 インストール方法修正、論文引用とtwitter追記 2019 10/30 コマンド微修正 2019 11/5 コマンド記載ミス修正 2019 3/24 コマンド記載ミス修正 Oxford Nanopore TechnologiesとPacific Biosciencesによって商品化されたロン…
