Frontiers in Microbiology
2017
Frontiers in Microbiology
web tool
Pathogen
bacteria
genotype
clinical and diagnostic
結果の可視化 (visualization)
系統解析
trimming / preprocessing
SNP
生物種の推定 (taxonomic profiling)
生物のゲノムDNAは生物学的にfunctionalな遺伝情報を持っている。生物の全ゲノム配列を解読することは、複雑な生物学研究における基本的なタスクである。以前は、完全なバクテリアゲノム配列を解読するために従来のサンガーシーケンシングが使用されていた。…
結果の可視化 (visualization)
metagenome
annotation
contamination
Binning (metagenomics)
2015
Frontiers in Microbiology
ほとんどの環境微生物が難培養性であることを考えると、microbial ecologyの分野では、metagenomicsは全コミュニティの機能を調べる手段に由来していた（論文より Handelsman、2004; Kunin et al、2008; Teeling and Glockner、2012）。研究者は、微生物群全…
