macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-06-20から1日間の記事一覧

(メタゲノム) ロングリードのビニングツール MetaBCC-LR

メタゲノム研究は、さまざまな環境下で見られる微生物群集の構成と構造に関する重要な知見を提供している。メタゲノムデータを解析するための技術のうち、ビニングは、存在するさまざまな微生物の種を特徴づけるための重要なステップと考えられている。しか…

joinx

Githubより Joinxは、vcfファイルや.bedファイルに含まれるゲノムデータに対して演算(交差、差分など)を行うための軽量ツールである。また、いくつかの限定的な解析機能(コンコーダンスレポート)も提供する。joinxは、入力データが常にソートされている…