様々な方法があるが、正確に出すのは意外に難しい（例えばsamtools mpileupは0カバレッジをカウントしない）。ここではBBtoolsのpileup.shを使い各クロモソームのカバレッジを個別に計算するコマンドを紹介する。 追記 2/26 コマンド修正 インストール BBtoo…

伝統的なウイルス同定法は単離および培養に依存しており、時間がかかるだけでなく、多くのウイルスおよび宿主が培地で増えないため実行不可能なことも多い。 2004年に登場したNGSの技術により、ウイルスとその存在量を迅速に測定することが可能になった。ウ…