macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

metazoa

アセンブル結果をCore gene setの検出数で評価する BUSCO

2018 1/9 version3のコマンドを最後に追記 2019 2/24 論文追記 ゲノムのアセンブルやde novo transcriptomeの評価手法の1つに、Core gene setがアセンブルされた配列の中にどれだけあるか調べる方法がある(core genesは構成的に発現していると考える)。そ…