macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

gDNA extraction

Microbial mat(微生物マット)からの高品質なgDNA抽出プロトコル

メタゲノムデータの正確で正確な分析と解釈は、高品質で高分子量(HMW)のコミュニティDNAの効率的な抽出にかかっている。しかしながら、environmental mat サンプルはしばしば高濃度の高品質HMW DNAを得ることを困難にする。好塩性微生物マットには、大量の…

ハイスループットDNAライブラリ作成に適したDNA抽出プロトコル

最近、次世代シーケンシング(NGS)を用いた、シーケンスによるジェノタイピング(GBS)などのハイスループット分子マーカー技術が開発された。これらの方法論は、ゲノムリソースに関係なく、ほとんどすべての種において、費用対効果の高い方法で迅速に数千…

低コスト且つ短時間で行える高分子量gDNA抽出プロトコル

2019 1/7 タイトル修正 複雑なゲノムの新規シーケンシングは、高品質のリファレンス配列を求める研究者にとっての主要な課題の1つである。 多くのde novoアセンブリはショートリードに基づいており、断片化されたゲノム配列を生成する。 リード長が10 kbを超…