macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

F1000Research

long readのRNA seq向けマッピング評価ツール AlignQC

Pacific Bioscience(PacBio)が20111年に1分子リアルタイム(SMRT)シーケンス技術を商品化し、第3世代シーケンシング(TGS)が登場した。TGSプラットフォームには大きな技術的違いがある。これは、第2世代シーケンス(SGS)とは異なる。ペアエンド情報を考…

メタゲノムcontigのカバレッジ、GC、taxonomy情報を可視化して分析できる BlobTools

2019 1/16 テストラン追加、diamondデータベースbuidコマンドエラー修正 2019 1/19 diamondデータベースbuidコマンド修正 2019 1/21 追記 2019 6/22 インストール追記 アセンブリしたcontig中に、アセンブリツールのアーティファクトやコンタミ由来のcontig…