Pacific Bioscience（PacBio）が20111年に1分子リアルタイム（SMRT）シーケンス技術を商品化し、第3世代シーケンシング（TGS）が登場した。TGSプラットフォームには大きな技術的違いがある。これは、第2世代シーケンス（SGS）とは異なる。ペアエンド情報を考…

long readのRNA seq向けマッピング評価ツール AlignQC

2019 1/16 テストラン追加、diamondデータベースbuidコマンドエラー修正 2019 1/19 diamondデータベースbuidコマンド修正 2019 1/21 追記 アセンブリしたcontig中に、アセンブリツールのアーティファクトやコンタミ由来のcontigが混じることは頻繁に起きる。…

メタゲノムcontigのカバレッジ、GC、taxonomy情報を可視化して分析できる BlobTools