F1000Research
2021 2/9 タイトル修正 2021 2/12, 2/15コマンド追記 2021 5/16 コメント追記 全ゲノムシークエンシング(WGS)は、精密医療の発展のための研究の基盤技術であるが、WGS解析のためのポータブルで使いやすいワークフローが限られていることが、多くの研究グルー…
タンパク質ファミリーデータベースは、タンパク質の機能を解剖しようとしている生物学者にとって重要なツールである。タンパク質ファミリーデータベースを運用する際には、何千もの既存のエントリと新しいファミリーの可能性を比較することが重要な作業とな…
2020 10/20 追記 非モデルアセンブリのコンピュータ アノテーション付き遺伝子の生物学的機能と、これらの遺伝子の産物によって形成される分子パスウェイの説明は、種のさまざまな固有の生物学的属性（生理学、生活史、行動など）の遺伝的基盤を特定するため…
このホワイトペーパーでは、Cytoscape用のオープンソースWikiPathwaysアプリ（http://apps.cytoscape.org/apps/wikipathways）を紹介する。WikiPathwaysアプリは、データの視覚化とネットワーク分析のためにバイオロジカルパスウェイをインポートするために…
Pacific Bioscience（PacBio）が20111年に1分子リアルタイム（SMRT）シーケンス技術を商品化し、第3世代シーケンシング（TGS）が登場した。TGSプラットフォームには大きな技術的違いがある。これは、第2世代シーケンス（SGS）とは異なる。ペアエンド情報を考…
2019 7/5 インストールエラー修正 2019 10/2 twitter追記 2020 1/5 twitter追記 2020 2/4 twitter追記 2020 2/20 コマンド修正 2020 2/27 help更新, コマンド修正 2020 5/5 twitter追記 sourmashは、ゲノムデータのMinHash sketchesを作成、比較、操作するた…
2019 1/16 テストラン追加、diamondデータベースbuidコマンドエラー修正 2019 1/19 diamondデータベースbuidコマンド修正 2019 1/21 追記 2019 6/22 インストール追記 2020 7/29 シミュレーション追記 2020 9/29 追記 アセンブリしたcontig中に、アセンブリ…
