macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

F1000Research

メタゲノムcontigのカバレッジ、GC、taxonomy情報を可視化して分析できる BlobTools

アセンブリしたcontig中に、アセンブリツールのアーティファクトやコンタミ由来のcontigが混じることは頻繁に起きる。そのため、アセンブリのクオリティチェックの一つにターゲットとなる生物以外の配列がどれほど混じっているか見積もることが重要になる。B…