macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-06-01から1日間の記事一覧

ロングリードを使ってSVを検出する Picky

ゲノム構造変異の獲得(SV)は、ガンゲノムの主要な特徴であるが、ショートリードシーケンシングデータから再構成することは困難である。ここでは、カスタマイズされたパイプライン、Picky(https://github.com/TheJacksonLaboratory/Picky)を使用し、ナノ…

CircosをWeb上 で利用できる ClicO FS

2020 7/24 関連文献追記 Circos(Krzywinski et al、2009)(HP)は、ビジュアルデータを環状形式で表現するPerl言語ベースのツールである。ネイティブのCircosソフトウェアは、コマンドラインインターフェイス(CLI)を介して提供されている。ソフトウェア…