bias
2021 2/20 論文引用、condaによるインストール追記 2021 3/1 追記 2021 5/25 エラーについて追記 ハイスループットのシーケンシングデータでは、生データから科学的な結果に至るまでのデータ処理において、計算ツール間の性能比較は、情報に基づいた意思決定…
2018
Journal of Microbiological Methods
amplicon sequence
review
PCR
archaea
bacteria
rRNA
wastewater
database
ヒト口腔 (human oral)
ヒト腸内 (human gut)
insect
qPCR
circular
dPCR
bias
OTU
polyploid
いくつかの例を挙げると、微生物群集は、地球規模の元素循環、排水処理プラントでの廃棄物除去、およびバイオガスプラントでのメタン生産を促進する、多くの自然および人工生態系における隠れたチャンピオンである。これらのシステムを理解しモデル化するた…
plant
結果の視覚化 (visualization)
ゲノム比較 (comparative genomics)
polyploid
GUIツール
dot plot
bias
2017
Bioinformatics
全ゲノム重複(WGD)などの倍数性事象は、単一の生物体内に2つ以上のゲノムコピーを作成する。重複(サブゲノム)に由来するホモロガスな染色体の全セットは、遺伝子が相同染色体の1つからlossするfractionationと呼ばれる過程で遺伝子欠損を受ける(Langham…
ArtificialFastqGeneratorはカバレッジGCバイアスを考慮可能なNGSリードのシミュレーター。イルミナのペアードエンドfastqに対応している。 比較表 Biostars https://www.biostars.org/p/124126/ ダウンロード javaの実行ファイルがダウンロードできる。 htt…