macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Genomics

NCBI submission用にGenBankをテーブル形式に変換する GB2sequin

一般的なウェットラボのユーザーは、ベクターNTI Advance(Life Technologies、Invitrogen、Carlsbad、CA、USA)またはLasergene SeqBuilder(DNASTAR、Madison、WI、USA)などの市販のシーケンス可視化およびアノテーションソフトウェアを使用して、プラス…

トランスクリプトームのblast比較結果を統合し、ベン図を描く VennBLAST

ハイスループットシークエンシングは広範な技術となり、進化的研究を含む様々な研究分野でアクセス可能となっている。ゲノムが利用できない生物の転写産物をシーケンスし、注釈を付ける能力は、分子進化の分野における生物学者、特に非モデル生物を含むルー…