アセンブリのgraph
2018 10/26 タイトル修正 ゲノム全体のデノボアセンブリの主要な課題は、リピートを解決することである[論文より 1,2]。リピートは、ゲノムの複数の位置で生じるほぼ同一のゲノム配列に対応する。この課題に対処するために、主に2つのタイプのアプローチが提…
assembly
evaluation tool
contigのscaffolding
結果の可視化 (visualization)
BMC Bioinformatics
2017
genome assembly reconciliation
アセンブリのgraph
2019 6/11 インストール追記、タイトル修正 ドライの計算技術およびウエット実験技術を利用して、ドラフトゲノムからゲノムを再構築する様々な方法が存在するが、それらはアセンブリの一部のみを生成する。したがって、異なる方法によって作製されたアセンブ…
2018 9/19 コマンド修正 2018 11/17 文章修正 2018 12/15 インストール追記 2019 2/28 追記 2019 3/19 scafofldsのコマンドのミス修正 2019 5/15リンク追加 bandageはde novo assemblerのfastgファイルを入力として、graphパスを描画してくれるツール。て201…
