macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

アセンブリのgraph

アセンブル結果の分析および統合を行う CAMSA

ドライの計算技術およびウエット実験技術を利用して、ドラフトゲノムからゲノムを再構築する様々な方法が存在するが、それらはアセンブリの一部のみを生成する。したがって、異なる方法によって作製されたアセンブリ結果を比較して統合することが重要となる…

アセンブルのgraphを可視化する GUIツール Bandage

2018 9/19 コマンド修正 bandageはde novo assemblerのfastgファイルを入力として、graphパスを描画してくれるソフトウエア。アセンブルを支援するツールとして2015年に論文が発表された。 インストール 公式サイト 公式サイトからdmgファイルをダウンロード…