macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-03-10から1日間の記事一覧

FASTQ、BED、BAMを操作するNGSUtilsその3 fastqutils

3回目はfastqを操作するfastqutilsを紹介する。 インストール 公式ページ NGSUtils - bedutils git clone git://github.com/ngsutils/ngsutils.gitcd ngsutils/make #依存がインストールされる(詳細はwebマニュアル参照) $ fastqutils Usage: fastqutils …

FASTQ、BED、BAMを操作するNGSUtilsその2 bedutils

bed

2回目はbedを操作するbedutilsを紹介する。 インストール 公式ページ NGSUtils - bedutils git clone git://github.com/ngsutils/ngsutils.gitcd ngsutils/make #依存がインストールされる(詳細はwebマニュアル参照) $ ./bedutils Usage: bedutils COMMAN…

FASTQ、BED、BAMを操作するNGSUtilsその1 bamutils

NGSUtilsは、FASTQ、BED、BAM形式のファイルなどを操作するためのツール。 Mac OS XおよびLinuxで動作する。コマンドが多いので3回に分けて紹介する。1回目はbamを操作するbamutils。 インストール 公式ページ NGSUtils - Tools for next-generation seque…