shiny
PLOS Biology
2019
インフォマティクス解析をサポートするツール
結果の視覚化 (visualization)
web tool
shiny
box plot
Figure (scientific illustration)
2019 4/11 twitterリンク追記 2020 3/2 関連リンク追加 近年、いくつかのグループが、データの要約ではなく実際のデータをグラフで表示することを提唱している[ref.1-4]。生データは、ヒストグラムやドットプロットなど、さまざまな方法で視覚化できる。デー…
2017
BMC Bioinformatics
web tool
RNA seq
結果の視覚化 (visualization)
venn diagram
heatmap
sequence clustering
multi-omic
multi-omics
shiny
Figure (scientific illustration)
次世代のシークエンシングベースのハイスループットアッセイによって生成されたトランスクリプトームデータ、ゲノムデータ、およびエピゲノムデータの効果的な可視化は、大きな関心の対象となっている。そのようなアッセイによって生成されたデータセットの…
2018
BMC Bioinformatics
RNA seq
RNAseqの定量
heatmap
GO enrichment analysis
automatic pipeline
human genome
barcode / index
education
web tool
venn diagram
Gene ID Conversion
Ensembl
shiny
GMT format
2019 5/23 tweet追記、9/26 動画追加、11/30 ツイート追記、12/22 統合TVリンク追加 2020 2/2 ８章補足資料リンク追加、12/15 ツイート追加 2024/04/04 論文追加引用 RNAシークエンシング（RNA-Seq）[1]は、ゲノムワイドな発現解析のための日常的な技術とな…
結果の視覚化 (visualization)
heatmap
高速なツール
RNA seq
2017
PLoS ONE
web tool
sequence clustering
shiny
Figure (scientific illustration)
ヒートマップソフトウェアは、一般に、静的ヒートマップソフトウェア (static heatmap software) [論文より ref.1-9]とインタラクティブヒートマップソフトウェア (interactive heatmap software) [ref.10-20]の2つのカテゴリに分類することができる。静的ヒ…
