macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-04-19から1日間の記事一覧

アセンブリグラフとペアエンドグラフを統合したマルチビューグラフベースのビニングアルゴリズム METAMVGL

微生物群集は複雑であるため、次世代シーケンサーデータを用いたde novoアセンブリでは、完全な微生物ゲノムを作成することができないのが一般的である。メタゲノム解析のビニングは、コンティグの塩基組成とリードデプスに基づき、断片化したコンティグをク…