macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-04-16から1日間の記事一覧

ロングリードデータを用いたプラスチドゲノムのアセンブリを行う ptGAUL

プラスチドゲノム(プラストーム)の構造は、ほとんどの種子植物で高度に保存されているが、過去20年間の研究により、大幅な再配列を経験したいくつかの異種族系統が明らかになっている。ほとんどのプラストームには、大きなインバーテッドリピートと2つのシ…

大規模なタンパク質構造セットを効率的に圧縮する Foldcomp

高精度なタンパク質構造予測により、数億個のタンパク質構造が生成されているが、これらは保存と処理の点で課題がある。本著者らは、この課題に対処するために、新しい非可逆構造圧縮アルゴリズムと索引付けシステムであるFoldcompを発表する。Foldcompは、…