macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-02-26から1日間の記事一覧

ヒト腸内細菌データベースを用いたオンラインのマイクロバイオーム解析を可能にする GutMeta

ヒトの腸内細菌は、多くの疾患と関連している。全ゲノムショットガンメタゲノミクスにより、膨大な量の腸内細菌データが蓄積されている。しかし、この膨大なデータセットを探索するためのキュレーションされた統合プラットフォームはほとんどない。データ生…

クロロプラストゲノムの詳細な構造を可視化する CPGView

クロロプラストゲノムは、植物の系統や進化を研究する上で広く利用されている。クロロプラストゲノムの可視化ツールは、ゲノム上の遺伝子の分布を表示するためにいくつか開発されている。しかし、これらのツールは、エクソン、イントロン、繰り返し要素、可…

2 つのアセンブリ間のアライメントを比較するNCBIの Comparative Genome Viewer

NCBI Insightsより NCBIのComparative Genome Viewer (CGV)では、2 つのアセンブリ間のアライメントを表示および比較し、欠失、逆位、転座を含むゲノム配列および構造の違いを確認することができます。 NCBIのComparative Genome Viewer (CGV)で利用できる全…