macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-02-15から1日間の記事一覧

染色体間で類似した遺伝子ブロックを可視化する AccuSyn

HPより 単純な生物でさえ膨大な数の遺伝的特徴を持つため、シンテニックプロットでは膨大な数の接続が乱立し、構造を理解することが困難となる。AccuSynは、ゲノムビューとブロックビューの2つのビューでシンテニック関係を可視化することにより、高いレベル…

線形遺伝子マップを生成する LinearDisplay

LinearDisplayは、ユーザー定義の遺伝的特徴(ORF、プロモーター、転写ターミネーター、制限酵素認識部位、プライマー結合部位、ファージ付着部位、標的部位重複、アセンブリ/コンティグ切断、RNA構造など)の出版品質の線形マップを生成するプログラムであ…