macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-10-13から1日間の記事一覧

ハプロタイプresolved のSNV、SV、およびメチル化を包括的に検出するPRINCESS

ロングリードシーケンスは、構造変異(SV)の検出やメチレーションコールに有利であることが示されている。多くの研究では、SV、メチル化、またはSNVのphasingのいずれかに焦点が当てられているが、バリアントの組み合わせによってのみ、サンプルに関する包…

大規模なメタゲノムアセンブリ(MAG)を対象とした比較ゲノミクスツール群 EnrichM

EnrichMは、大規模なメタゲノム・アセンブリゲノム(MAG)を対象とした比較ゲノミクスツール群である。現在の機能は以下の通りである。 MAGの基本的なアノテーションパイプライン。 KEGGモジュールを参考にして、MAGがコード化している代謝パスウェイを決定…