macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-02-10から1日間の記事一覧

nf-coreのDeepVariantパイプライン

nf-core/deepvariantより 2017年12月にGoogleブレインチームがDeepLearningをベースにしたVariant Caller, DeepVariantをリリースした。DeepVariantはまずBAMファイルに基づいて画像を構築し、次にDeepLearningの画像認識アプローチを使用してバリアントを取…