macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2019-02-09から1日間の記事一覧

pacbioのアライナー pbmm2

pbmm2はminimap2のC API用のSMRT C ++ラッパーである。 その目的は、ネイティブのPacBio入出力をサポートし、推奨パラメータセットでソート出力をon-the-fly(複数の処理をまとめて)で生成することである。 BAMがpbmm2への入力として使用されている場合は、…