macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-11-01から1ヶ月間の記事一覧

複数のアセンブラとk-merを使ったTranscriptome 自動アセンブリワークフロー Oyster River Protocol

2018 11/2 コマンド追記 & 誤字修正 2018 11/7 誤字修正 2019 4/6 docker追記 2019 6/17 追記、誤字修正 2019 6/21追記 2019 7/5 Step by step instructions link追記 現代のシーケンシング技術は細胞内の代謝過程から人口変動パターンまで、非常に幅広い自…

メタゲノムシーケンシングデータからMLST タイピングを行う MetaMLST

2020 5/24 レポジトリが引っ越ししているので、リンク更新 2022/09/06 インストール手順更新 高分解能の微生物菌株同定およびトレースは、臨床および研究環境の両方において重要な課題である。微生物の菌株レベルのタイピングのための最も一般的な方法の1つ…