macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-10-15から1日間の記事一覧

ロングリードのハイブリッドエラーコレクションツール Hercules

2018 10/15 誤字修正 2019 5/23 ”make -j 8”に修正, docke help追記 ハイスループットシーケンシング(HTS)技術は、ゲノミクスの分野に革命をもたらしたが、2つの基本的な制限がある。まず第一に、プラットフォームはまだ染色体のロングリードを生成するこ…

WGSデータからミトコンドリアゲノムをアセンブルする NORGAL

ミトコンドリアなどの特定の細胞小器官には、独自の異なるゲノムが存在している。ミトコンドリアゲノム - the mitogenome - は、真核生物の核ゲノムとは著しく異なる。典型的に環状であり、サイズがより小さい[ref.1]。The mitogenomeは、ミトコンドリアを単…