macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-11-15から1日間の記事一覧

NCBIからvirusゲノムをダウンロードする

Accession IDを使い、virusのゲノム配列(FASTA)をダウンロードする。 NCBIのvirus Genomesに移動する。 左下の方の"Accession list of all viral genomes"をクリックしてvirusのリストをダウンロードする。 このようなリストが入手できる。 user$ head taxid…