macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-10-26から1日間の記事一覧

ハイブリッドアセンブリにも対応したショートリードアセンブラ Unicycler

2019 追記、 dockerリンク追加、help all追加、コメント追記 2020 help更新、追記 2021 2/25 誤字修正 2021 5/9 ツイート追加 2022 1/25 v5に対応してインストール手順を修正 2022/02/22, 09/21 インストール手順を修正 現在、バクテリアゲノムはIlluminaシ…

ハイブリッドアセンブルを行うquickmerge

2021 6/17 condaインストール追記 quickmergeは、ロングリード情報を使い、アセンブルのcontiguityを向上させるツール。特にロングリードのカバレッジがmodestな時にcontiguityが大きく向上するとされる。他のツールのアセンブル結果を入力ファイルとする。 …