macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-09-05から1日間の記事一覧

メタゲノムの簡単なシミュレートを行う BBMap

メタゲノムをシミュレートするには、ゲノムごとのインサートサイズや増幅biasなどを考慮する必要があり、厳密に行うと計算が複雑になる。また計算リソースも高度に要求される。そのためGPUを使ったシミュレーションツールなども登場している。それに加えて、…