macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Artemis使用法

Artemisはサンガー研で開発されたゲノムデータをビジュアルで見れるソフト。ゲノムのデータ(genebakファイルなど)を読み込ませると、遺伝子単位まで拡大して確認できる。ダウンロードはここから http://www.sanger.ac.uk/science/tools/artemis

 

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Macなら、写真のMac OSをクリック。自動的にダウンロードが開始される。ダウンロードした.dmgファイルを解凍するとArtemisが表示される。Applicationにコピーしてインストール完了。 起動したらFile -> open... を選択し、

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genebakフォーマットのファイル(.gbk)を選択する。

 

読み込むと以下のようにorfを可視化して表示できる。

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拡大縮小方法はやや特殊。

上の右端に小さな灰色ゲージが見えるが、これをマウスで上下に引っ張れば拡大縮小される。ゲノム全体を表示することもできる。

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