small eukaryotes
metagenome
microbial eukaryotes
small eukaryotes
Binning (metagenomics)
2021
Preprint
テスト失敗
2022
Microbial Genomics
2022/05/04 追記 メタゲノミクスは、微生物群集に含まれるすべての生物の機能的可能性を研究するための著名な技術となっている。しかし、ほとんどの研究では、真核微生物を無視して、微生物群集に含まれるバクテリアに焦点を当てている。実際、多くのメタゲ…
2021
Bioinformatics
deep neural network
Binning (metagenomics)
microbial eukaryotes
small eukaryotes
Marine Metagenomics
organelle genome
多くのメタゲノムデータが利用可能になるにつれ、真核生物のメタゲノム解析が新たな課題として浮上してきた。真核生物の核およびオルガネラのゲノムを適切に分類することは、真核生物の多様性をより深く理解するために不可欠なステップである。 メタゲノムデ…
metagenome
small eukaryotes
eukaryotic genome annotation
生物種の推定 (taxonomic profiling)
evaluation tool
Genome Biology
2020
UniProt
phylogenetic marker genes
微生物のDNAは日常的に抽出され、配列決定され、ゲノムにアセンブリされている。回収されたゲノムの品質を推定することは、不完全なゲノムや汚染されたゲノムが公表されるのを防ぐために非常に重要である。シングルコピーマーカー遺伝子(SCMG)は、新たにア…
evaluation tool
assembly
結果の視覚化 (visualization)
telomere
small eukaryotes
G3: Genes, Genomes, Genetics
2018
2022/12/30 追記 ゲノムには、複製、転座、大きな逆位、倍数性変異などの複雑な機能が含まれている可能性があり、アセンブリやアセンブリの検証が困難になる場合がある。John Daveyが開発したTapestryと呼ばれるツールを使用すると、小さく、ほぼ完全な真核…