macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

recombination

細菌ゲノムの組換えを推論する ClonalFrameML

組換えは細菌において重要な進化の力であるが、ゲノムサンプルの祖先に起こった組み換えを再構築することは依然として困難である。本発表では、最尤推論を用いて細菌ゲノム中の組換えを検出し、系統樹の再構築に反映させるClonalFrameMLを紹介する。ClonalFr…

タンパク質をコードする遺伝子配列の組換えイベントや正の選択下にある部位を見つける PoSeiDon

2020 10/27 テストデータ結果追記 選択圧力は、遺伝子の進化に継続的に影響を与え、多くの方法で研究することができる(Vittiら、2013)。例えば正の選択、または多様化する選択は、オルソロガスな遺伝子のアラインメントにおける非同義置換(dN)と同義置換…