metabolism
2020
Nucleic Acids Research
2016
2010
BMC Bioinformatics
web tool
Pathway
metabolism
bacteria
bacterial annotation
human genome
database
BMC Bioinformatics. 2010 Apr 29;11:213 COBRA（Constraint Based Reconstruction and Analysis）フレームワークに基づくゲノムスケールの代謝再構成は、生物の代謝能力を解析し、実験データを解釈するための貴重なツールである。このような再構成や解析手…
2019
Frontiers in Genetics
metagenome
automated pipeline
annotation
結果の視覚化 (visualization)
taxonomic assignment
生物種の推定 (taxonomic profiling)
abundance estimation in metagenomics data
pathway
rRNA
database
GO term
enzyme
Binning (metagenomics)
secondary metabolites
metabolism
2019/10/24 MetaCycの結果追記 2021 1/27 誤字修正 ゲノムアノテーションは、文字通り、アセンブリされたDNA分子の特徴の注釈である。そのような特徴は、そもそも、タンパク質をコードする遺伝子[「オープンリーディングフレーム」（ORF）]およびリボソーム…
