macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

amino acids

NCBIのデータベースへのリモート検索によって保存された遺伝子クラスターを探索し、クラスタリングして視覚化する cblaster

2020 11/11 extractコマンド追記 代謝、薬剤耐性、病原性などの生物学的パスウェイに関与する遺伝子は、多くの場合、遺伝子クラスターとしてクラスター化されている。相同な遺伝子クラスターを特定することは、その機能や進化の研究に役立つが、既存のツール…

バクテリアとアーキアのアミノ酸生合成パスウェイを調べる GapMind

2021 1/15 ファイルサイズが大きいと受け付けないエラーが修正されたのを確認 ゲノム配列は何万もの微生物について利用可能である。これらの微生物のほとんどについては、分離された条件以外にその生理学についてはほとんど知られていない。また、酵母エキス…