macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-04-12から1日間の記事一覧

GenBankファイルから配列とメタデータを取り出す gbmunge

この小さなCプログラムgbmungeは、GenBankファイルをFASTA配列とタブで区切られたメタデータに変換する。 GenBankファイルから以下の情報を抽出する。 名前 アクセッション 長さ 投稿日 ホスト 国 収集日 これらの情報を抽出するだけでなく、日付はBEASTのよ…