macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-01-22から1日間の記事一覧

オーバーラップグラフに基づいたde novoゲノムアセンブラ ALGA

2021 1/22 誤字修正 オーバーラップグラフ法に基づいたde novoゲノムアセンブリの手法は非常に少ない。いわゆるde Bruijnグラフアプローチよりも正確な結果が得られると考えられているが、より多くの時間とより多くのメモリを必要とする。オーバーラップグラ…

BLAST結果をソート・フィルタリングする BLAST-QC

NCBIのBasic Local Alignment Search Tool (BLAST)は、バイオインフォマティクスおよびゲノミクス研究のための配列アライメントおよび同定のための好ましいユーティリティである。NCBIのBLASTソフトウェアを使用している研究者の間では、大規模なBLAST検索の…