2021 2/2 追記 COVID-19 パンデミックを契機に，コロナウイルス研究への関心が高まっている．コロナウイルスデータセットの解析は、リードアラインメントまたはde novo assemblyを用いて完全長ウイルスゲノム配列を得ることから始まる。リードアラインメント…

CoronaSPAdes

ハプロタイプベースのバリアント検出方法は、一度に1つの位置で動作する方法に比べて多くの利点を提供する。ハプロタイプベースの方法は、同じコンテキストで対立遺伝子のすべてのクラスを同時に評価することにより、記述されたバリアント間の意味の一貫性を…

バリアントコーラー FreeBayes