macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2020-12-15から1日間の記事一覧

大規模な微生物ゲノムの系統推定を行う PhyloPhlAn 3.0(メタゲノムアセンブリにも対応)

2020 12/17 誤字修正 2021 1/25 help追記, linkミス修正 単離物やメタゲノムアセンブリ、シングルセルのゲノム配列解読はますます加速しており、これらはすべて公的資源によって利用可能になってきている。これにより、人体や地球に影響を及ぼす微生物の多様…

GFF/GTFのfeatureをマージする feature_merge

タイトルの通りのツール。 インストール macos10.14でcondaを使って導入した。 依存 Github #bioconda (link)conda install -c bioconda -y feature_merge#pip (pypi)pip install feature-merge > feature_merge -h $ feature_merge -h Argument error( h ):…