macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2020-12-01から1日間の記事一覧

コンティグを遺伝子含有量に基づいてプラスミドか非プラスミドかに分類する plasmidVerify

2023/10/01 追記 プラスミドは細菌の生存と適応に重要であるが、ゲノムはもちろん、メタゲノムサンプルからのプラスミド検出とアセンブリは依然として困難である。最近開発されたplasmidSPAdesアセンブラは、単離ゲノムの場合にはこれらの課題のいくつかに対…