macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2020-05-30から1日間の記事一覧

従来型のMLSTタイピングを行う mlst

2020 6/4 コマンド修正 mlstは、ゲノム配列を入力として伝統的な7つの遺伝子座に対するタイピングを行う。PubMLSTのタイピングスキームに従う。 インストール 依存 Perl >= 5.26 NCBI BLAST+ blastn >= 2.9.0 You probably have blastn already installed a…