macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2019-11-17から1日間の記事一覧

GATKのgenotyping結果を反映したゲノム配列を出力する VCF2Genome

このメソッドはEAGERの機能の1つで、VCFファイルのバリアントを組み込んだFastAファイルを生成するために使用できる。 バクテリアのデータに特に有用である。この機能により、ユーザーは、ジェノタイピングの最低品質、カバレッジ、およびSNP対立遺伝子頻度…