macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2019-07-22から1日間の記事一覧

fasta/fastqのlow complexity領域をマスクする komplexity

komplexityはFAST [A / Q]ファイルから複雑度の低いシーケンスをすばやく計算および/またはマスクするために開発された。複雑さを評価するために、長さで割ったシーケンス上の一意のk-mer値を使用する。例えばk = 4の場合、正規化複雑度スコアが<0.55である…