macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2019-06-01から1日間の記事一覧

(ウィリス向け)高感度なHMMベースのアライナ ngshmmalign

現在のシーケンシンでは、NGSのリードのアラインメントはbwa(http://bio-bwa.sourceforge.net)やbowtie(http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml)などのアライナを使用して行われる。 これらのアライナは高速で、大きな真核生物ゲノムの…