macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2019-03-15から1日間の記事一覧

グラフィック出力が利用できない環境で頻度分布を素早く確認できる bashplotlib

bashplotlibは、端末で基本的なプロットを作成するためのpythonパッケージおよびコマンドラインツール。 GUIがない場合にデータを視覚化する簡単な方法を提供する。pythonでコーディングされており、pipを使って素早くインストールできる。 特徴(githubより…

ウィルス分類器 viruses_classifier

次世代シーケンシング(NGS)の台頭により、メタゲノムは微生物生態学におけるゴールドスタンダードとなった。その限界、主にウイルス間の普遍的なマーカー遺伝子の欠如にもかかわらず、ウイルスメタゲノミクスはウイルス発見のための主要なツールとなってい…