macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-12-11から1日間の記事一覧

SPAdesとUnicyclerでlarge k-merを使えるようにビルドし直す part1

文章修正 これまではk-merの値を増やしても、k-merのピークがノイズの中に埋もれてしまうので意味がないと思いこんでいたが、SKESA(紹介)は、ペアエンドリードをマージし、リード長以上の長いk-merも使ってde brujin gaphを構築し、より長いunitigを構築す…