2018-10-09から1日間の記事一覧
2017
Bioinformatics
系統解析
結果の視覚化 (visualization)
web tool
分子系統樹
高速なツール
Figure (scientific illustration)
phylogenetic tree viewer
系統樹の可視化は、計算系統学(computational phylogenetics)の極めて重要な側面である。確かに、よく知られているテキスト「Inferring Phylogenies」(Felsenstein、2003)(amazon) は、このトピックに全章を割いている。従って、系統樹可視化ソフトウェ…
2018
Nucleic Acids Research
bacteria
archaea
metagenome
pan-genome
phylogenetic marker genes
rRNA
web tool
生物種の推定 (taxonomic profiling)
系統解析
結果の視覚化 (visualization)
Small subunit ribosomal RNA gene (16S)は、30年以上にわたり、原核生物種およびそのコミュニティの多様性をカタログ化および研究するために首尾よく使用されてきた。しかしながら、16S(論文より ref.1)によって効率的に評価することができない種および…