macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-08-21から1日間の記事一覧

Varscan2のCNV検出をワンライナーで行うラッパーツール

Varscan2のtumor-nomalペアのCNV検出をワンライナーで行うラッパーツールが公開されている。 Varscan2 VarScan - Variant Detection in Massively Parallel Sequencing Data 以下の作業を行う。 The Varscan wrapper script runs the following: samtools fl…